جشنواره درون دانشگاهی شهید مطهری هر ساله قبل از فراخوان جشنواره شهید مطهری توسط مرکز مطالعات و توسعه آموزش علوم پزشکی وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، در دانشگاه علوم پزشکی گناباد برگزار می گردد. دبیرخانه این جشنواره با ترکیب اعضای پیشنهادی مرکز مطالعات و معاونت آموزشی دانشگاه در ابتدای هر سال تحصیلی کار خود را آغاز می نماید و فراخوان مربوط به فرآیندهای نوآورانه آموزشی را اعلام می کند. هریک از اعضای هیأت علمی دانشگاه فرآیندهای نوآورانه خود را جهت داوری اولیه در دبیرخانه درون دانشگاهی جشنواره به مرکز مطالعات دانشگاه ارسال می نمایند و در ادامه کمیته داوران جشنواره درون دانشگاهی، داوری و ارزیابی فرآیندها را انجام می دهند و هرکدام از فرآیندهای ارسالی از سوی اعضای هیأت علمی دانشگاه که معیارهای لازم و ضروری را داشته باشند، انتخاب می گردند و به دبیرخانه کشوری جشنواره شهید مطهری وزارت بهداشت ارسال می گردند و در سایت جشنواره شهید مطهری بارگذاری می گردند.
ترکیب اعضای جشنواره درون دانشگاهی شهید مطهری در سال تحصیلی ۱۴۰۲-۱۴۰۱ به شرح زیر می باشد:
دبیر جشنواره: معاون آموزشی دانشگاه - دکتر رضا اسماعیلی
دبیر علمی جشنواره: مدیر مرکز مطالعات دانشگاه - دکتر موسی سجادی
دبیر اجرایی جشنواره: خانم صدیقه بادنوا - کارشناس مرکز مطالعات دانشگاه
مسئول دبیرخانه جشنواره: آقای هاشم فلاح - کارشناس مرکز مطالعات دانشگاه
کمیته داوران جشنواره:
دکتر موسی سجادی
دکتر محمدرضا منصوریان
خانم دکتر نرجس بحری
خانم دکتر نجمه قربانی
آقای هاشم فلاح
خانم صدیقه بادنوا
